Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDE2Q6IQ49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDE2Q6IQ49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms