Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR44Q5JSH3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR44Q5JSH3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms