Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A9Q2M3M2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A9Q2M3M2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms