Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 GCN3YKR026C 918 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YML079WYML079W 606 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 IRC11YOR013W 471 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 ODC2YOR222W 924 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 CST26YBR042C 1194 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 VPS72YDR485C 2388 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 APE4YHR113W 1473 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YFL042CYFL042C 2025 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YMR034CYMR034C 1305 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 MRPS28YDR337W 861 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 EDC2YER035W 438 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YAP1801YHR161C 1914 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 BNA5YLR231C 1362 nt6.28□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 IES1YFL013C 2079 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YGL072CYGL072C 360 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YJR107WYJR107W 987 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YLR296WYLR296W 327 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 COX5AYNL052W 462 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 ADH5YBR145W 1056 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SIT1YEL065W 1887 nt6.27□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 PFK2YMR205C 2880 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SEC18YBR080C 2277 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 CWC21YDR482C 408 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YGL102CYGL102C 429 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SMX3YPR182W 261 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 DDC1YPL194W 1839 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 AAP1YHR047C 2571 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SFB3YHR098C 2790 nt6.26□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 HIS1YER055C 894 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YLR162WYLR162W 357 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 TOS6YNL300W 309 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 VPS5YOR069W 2028 nt6.25□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YHR020WYHR020W 2067 nt6.24□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.24□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 ICP55YER078C 1536 nt6.24□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 YDR415CYDR415C 1125 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SOH1YGL127C 384 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 PRI1YIR008C 1230 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 JJJ3YJR097W 519 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 CUE4YML101C 354 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SEC62YPL094C 825 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 SUE1YPR151C 621 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 VMS1YDR049W 1899 nt6.23□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 HEM1YDR232W 1647 nt6.22□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 ICT1YLR099C 1185 nt6.22□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 STT3YGL022W 2157 nt6.22□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 MSS116YDR194C 1995 nt6.22□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 MSC3YLR219W 2187 nt6.21□□□□□ -1.41
NFI1Q12216 UBA1YKL210W 3075 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 TAX4YJL083W 1815 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 HED1YDR014W-A 489 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 PUP2YGR253C 783 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 PHO86YJL117W 936 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YKR032WYKR032W 315 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 TNA1YGR260W 1605 nt6.21□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 PAP1YKR002W 1707 nt6.2□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YPT1YFL038C 621 nt6.2□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YLL056CYLL056C 897 nt6.2□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YNL092WYNL092W 1203 nt6.2□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 ERG10YPL028W 1197 nt6.2□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 TAH18YPR048W 1872 nt6.19□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 FMP40YPL222W 2067 nt6.19□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YMR155WYMR155W 1644 nt6.19□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 DOT1YDR440W 1749 nt6.19□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 AIM17YHL021C 1398 nt6.18□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 HEM2YGL040C 1029 nt6.18□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 MRPL19YNL185C 477 nt6.18□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 TMA46YOR091W 1038 nt6.18□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 SSK1YLR006C 2139 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 NUP49YGL172W 1419 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 COQ1YBR003W 1422 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 ARO10YDR380W 1908 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 PMT3YOR321W 2262 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 ATG36YJL185C 882 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YKL223WYKL223W 333 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 ASR1YPR093C 867 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YNL247WYNL247W 2304 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 RRN3YKL125W 1884 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 EDE1YBL047C 4146 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YJL163CYJL163C 1668 nt6.17□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 UTP4YDR324C 2331 nt6.16□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 AIM46YHR199C 933 nt6.16□□□□□ -1.42
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