Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP107P57740 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP107P57740 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP107P57740 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP107P57740 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP107P57740 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP107P57740 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP107P57740 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP107P57740 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP107P57740 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP107P57740 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP107P57740 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP107P57740 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP107P57740 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP107P57740 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP107P57740 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP107P57740 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP107P57740 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP107P57740 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP107P57740 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP107P57740 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP107P57740 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP107P57740 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP107P57740 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP107P57740 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP107P57740 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP107P57740 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP107P57740 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP107P57740 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP107P57740 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP107P57740 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP107P57740 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP107P57740 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP107P57740 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP107P57740 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP107P57740 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP107P57740 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP107P57740 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP107P57740 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP107P57740 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP107P57740 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP107P57740 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP107P57740 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP107P57740 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP107P57740 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP107P57740 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP107P57740 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP107P57740 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP107P57740 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms