Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BRCA2P51587 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRCA2P51587 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRCA2P51587 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRCA2P51587 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRCA2P51587 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRCA2P51587 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BRCA2P51587 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRCA2P51587 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRCA2P51587 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRCA2P51587 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRCA2P51587 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRCA2P51587 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRCA2P51587 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRCA2P51587 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
BRCA2P51587 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
BRCA2P51587 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRCA2P51587 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRCA2P51587 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms