Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT3P45378 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT3P45378 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms