Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA3P42263 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms