Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA3P29320 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms