Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1P21675 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1P21675 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TAF1P21675 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TAF1P21675 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1P21675 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1P21675 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1P21675 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAF1P21675 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAF1P21675 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TAF1P21675 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF1P21675 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF1P21675 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF1P21675 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF1P21675 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF1P21675 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1P21675 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1P21675 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1P21675 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1P21675 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1P21675 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1P21675 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1P21675 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1P21675 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1P21675 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1P21675 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1P21675 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1P21675 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAF1P21675 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1P21675 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1P21675 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAF1P21675 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1P21675 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1P21675 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1P21675 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF1P21675 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TAF1P21675 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF1P21675 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF1P21675 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF1P21675 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF1P21675 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAF1P21675 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAF1P21675 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAF1P21675 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAF1P21675 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF1P21675 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF1P21675 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF1P21675 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF1P21675 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF1P21675 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF1P21675 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF1P21675 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF1P21675 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF1P21675 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF1P21675 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF1P21675 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF1P21675 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TAF1P21675 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TAF1P21675 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TAF1P21675 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TAF1P21675 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TAF1P21675 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms