Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD8P13378 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXD8P13378 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms