Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM13P0DJ93 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM13P0DJ93 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms