Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPP01282 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPP01282 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPP01282 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPP01282 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPP01282 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPP01282 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPP01282 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPP01282 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPP01282 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPP01282 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPP01282 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIPP01282 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIPP01282 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIPP01282 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPP01282 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPP01282 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPP01282 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPP01282 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPP01282 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPP01282 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPP01282 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPP01282 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPP01282 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPP01282 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIPP01282 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIPP01282 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIPP01282 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPP01282 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPP01282 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPP01282 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPP01282 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPP01282 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPP01282 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPP01282 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPP01282 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPP01282 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPP01282 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPP01282 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms