Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB2O95900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms