Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEC24BO95487 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC24BO95487 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC24BO95487 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms