Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC1O94876 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC1O94876 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms