Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM3APO60318 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3APO60318 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3APO60318 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3APO60318 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3APO60318 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3APO60318 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3APO60318 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3APO60318 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM3APO60318 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM3APO60318 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM3APO60318 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM3APO60318 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM3APO60318 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM3APO60318 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM3APO60318 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MCM3APO60318 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM3APO60318 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCM3APO60318 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3APO60318 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3APO60318 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3APO60318 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3APO60318 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
MCM3APO60318 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■■□□ 2
MCM3APO60318 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MCM3APO60318 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM3APO60318 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms