Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms