Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMT12Q53H54 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms