Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDV3Q9UKY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDV3Q9UKY7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDV3Q9UKY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms