Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS18Q9P253 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
VPS18Q9P253 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS18Q9P253 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms