Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-10■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.146e-10■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 312.73□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 418.4■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.667e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 217.18■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 HMGCR-208ENST00000509431 421 ntTSL 215.64■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 514.71□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 313.87□□□□□ -0.197e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.047e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.819e-8■■■■■ 34.9
FAM120AQ9NZB2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 34.8
FAM120AQ9NZB2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 34.8
FAM120AQ9NZB2 LRRC42-204ENST00000444987 1044 ntTSL 520.4■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 34.8
FAM120AQ9NZB2 LRRC42-202ENST00000371368 838 ntTSL 318.66■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 34.8
FAM120AQ9NZB2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 34.8
FAM120AQ9NZB2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.987e-7■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.265e-27■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.765e-27■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 CD276-210ENST00000560928 2181 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 34.7
FAM120AQ9NZB2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-32■■■■■ 34.6
FAM120AQ9NZB2 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.581e-32■■■■■ 34.6
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 422.02■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.48■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 320.4■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 219.93■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 416.8■□□□□ 0.288e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 316.27■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 34.5
FAM120AQ9NZB2 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 530.81■■■□□ 2.524e-29■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.476e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 AP2S1-205ENST00000597421 554 ntTSL 223.45■■□□□ 1.346e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.316e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.296e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.256e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.126e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 FIZ1-204ENST00000590714 4686 ntTSL 1 (best)20.64■□□□□ 0.896e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.756e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 GOLGA2-209ENST00000490257 1964 ntTSL 219.19■□□□□ 0.666e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.26e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.136e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 SOGA1-203ENST00000463491 802 ntTSL 215.49■□□□□ 0.076e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 GOLGA2-202ENST00000450617 1439 ntTSL 515.37■□□□□ 0.056e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 GOLGA2-206ENST00000468488 531 ntTSL 313.5□□□□□ -0.256e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.456e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 211.99□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 511.96□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 WNK2-215ENST00000478583 537 ntTSL 411.7□□□□□ -0.546e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.616e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 511.04□□□□□ -0.646e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 COG4-210ENST00000564315 729 ntTSL 28.91□□□□□ -0.986e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.256e-10■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 POLR3A-205ENST00000616246 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 34.76□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 34.4
FAM120AQ9NZB2 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.84■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 416.19■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 MCF2L-214ENST00000423251 734 ntTSL 319.88■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF846-211ENST00000592587 548 ntTSL 514.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF846-203ENST00000586814 482 ntTSL 514.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF846-207ENST00000589412 683 ntTSL 510.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF846-204ENST00000587650 561 ntTSL 49.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF846-209ENST00000590471 427 ntTSL 39.17□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 34.3
FAM120AQ9NZB2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 DTX2-207ENST00000435251 547 ntTSL 514.95□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 DTX2-217ENST00000467729 496 ntTSL 510.1□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 222.69■■□□□ 1.222e-9■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.39□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-10■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-10■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 ITIH2-206ENST00000480387 573 ntTSL 38.56□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 ITIH2-203ENST00000429820 767 ntTSL 38.24□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 34.2
FAM120AQ9NZB2 MFHAS1-203ENST00000520715 444 ntTSL 320.67■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 MFHAS1-204ENST00000521881 577 ntTSL 320.14■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 AC068533.4-201ENST00000450043 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.732e-9■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 314.04□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.33e-12■■■■■ 34.1
FAM120AQ9NZB2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.484e-19■■■■■ 34
FAM120AQ9NZB2 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 217.34■□□□□ 0.374e-19■■■■■ 34
FAM120AQ9NZB2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 34
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 294.7 ms