Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RDH8Q9NYR8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms