Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SAR1AQ9NR31 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAR1AQ9NR31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAR1AQ9NR31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SAR1AQ9NR31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms