Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQI0

DDX4, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX4Q9NQI0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX4Q9NQI0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX4Q9NQI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX4Q9NQI0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX4Q9NQI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms