Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC3Q9BY71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC3Q9BY71 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms