Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRXQ9BXM0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PRXQ9BXM0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PRXQ9BXM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRXQ9BXM0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRXQ9BXM0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRXQ9BXM0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRXQ9BXM0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRXQ9BXM0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRXQ9BXM0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRXQ9BXM0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms