Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
C1QTNF1Q9BXJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF1Q9BXJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF1Q9BXJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms