Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FYCO1Q9BQS8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
FYCO1Q9BQS8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
FYCO1Q9BQS8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms