Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBOF1Q8ND07 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOF1Q8ND07 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms