Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC62Q6P9F0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC62Q6P9F0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms