Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3CQ5T2N8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3CQ5T2N8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 624 ms