Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CFAP70Q5T0N1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFAP70Q5T0N1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP70Q5T0N1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP70Q5T0N1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms