Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF4BQ13523 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF4BQ13523 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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