Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 CTK2YJL006C 972 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YAL045CYAL045C 309 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 OAC1YKL120W 975 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 SLM4YBR077C 489 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YCR061WYCR061W 1896 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 AMN1YBR158W 1650 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 SAS4YDR181C 1446 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 ENT5YDR153C 1236 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 SUT1YGL162W 900 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 PAC10YGR078C 600 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 RPR1RPR1 369 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YNL228WYNL228W 777 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 snR30snR30 606 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 MSG5YNL053W 1470 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 NAF1YNL124W 1479 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 AFG2YLR397C 2343 nt7.28□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 MSB3YNL293W 1902 nt7.27□□□□□ -1.25 RIP-Chip
PUF3Q07807 VPS20YMR077C 666 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YIF1YNL263C 945 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YNR005CYNR005C 405 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 SSP2YOR242C 1116 nt7.27□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YOX1YML027W 1158 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 HTZ1YOL012C 405 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YAP7YOL028C 738 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YOL099CYOL099C 492 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 LAT1YNL071W 1449 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 CEM1YER061C 1329 nt7.26□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 CDS1YBR029C 1374 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 RMD5YDR255C 1266 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YEA4YEL004W 1029 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YER138W-AYER138W-A 105 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 RPF2YKR081C 1035 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YLR162WYLR162W 357 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YCL049CYCL049C 939 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 MCH2YKL221W 1422 nt7.25□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 MRPL28YDR462W 444 nt7.24□□□□□ -1.25 RIP-Chip
PUF3Q07807 AIM46YHR199C 933 nt7.24□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 NTG2YOL043C 1143 nt7.24□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 DAL7YIR031C 1665 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 snR57snR57 88 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 HHY1YEL059W 309 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 CUS2YNL286W 858 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 BAG7YOR134W 1230 nt7.23□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 TUF1YOR187W 1314 nt7.23□□□□□ -1.25 RIP-Chip
PUF3Q07807 HXT13YEL069C 1695 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 ERS1YCR075C 783 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 GCV1YDR019C 1203 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YGR066CYGR066C 879 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YJR115WYJR115W 510 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 SPG5YMR191W 1122 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 YOL024WYOL024W 519 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 HEM15YOR176W 1182 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 RRP15YPR143W 753 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 NUP84YDL116W 2181 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF3Q07807 OKP1YGR179C 1221 nt7.21□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YKR075CYKR075C 924 nt7.21□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 ATG29YPL166W 642 nt7.21□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YKR015CYKR015C 1707 nt7.21□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 DIT1YDR403W 1611 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 OCA4YCR095C 1089 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 HMRA1YCR097W 381 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YDR161WYDR161W 1164 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 TCA17YEL048C 459 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SKI6YGR195W 741 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 CTR3YLR411W 726 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 GTR1YML121W 933 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SGV1YPR161C 1974 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 APE4YHR113W 1473 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 CYB2YML054C 1776 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 REC107YJR021C 945 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SAW1YAL027W 786 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RAD17YOR368W 1206 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SRF1YDL133W 1314 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YBR241CYBR241C 1467 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RAM1YDL090C 1296 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RPC53YDL150W 1269 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 UBC5YDR059C 447 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SLD7YOR060C 774 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 KAR1YNL188W 1302 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 NMT1YLR195C 1368 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 VBA5YKR105C 1749 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YGL102CYGL102C 429 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YHR140WYHR140W 720 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SEC28YIL076W 891 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 HBN1YCL026C-B 582 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 MFG1YDL233W 1377 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 CIR2YOR356W 1896 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 BRL1YHR036W 1416 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 IPI3YNL182C 1668 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 MAK32YCR019W 1092 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YDL129WYDL129W 876 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.9 ms