Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CALD1Q05682 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CALD1Q05682 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms