Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ROMO1P60602 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms