Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAG2P55895 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAG2P55895 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAG2P55895 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAG2P55895 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAG2P55895 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAG2P55895 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAG2P55895 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAG2P55895 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAG2P55895 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAG2P55895 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAG2P55895 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAG2P55895 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAG2P55895 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAG2P55895 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAG2P55895 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAG2P55895 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAG2P55895 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAG2P55895 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAG2P55895 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAG2P55895 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAG2P55895 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAG2P55895 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAG2P55895 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAG2P55895 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAG2P55895 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAG2P55895 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAG2P55895 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAG2P55895 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAG2P55895 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAG2P55895 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAG2P55895 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAG2P55895 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAG2P55895 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAG2P55895 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAG2P55895 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms