Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB4P17483 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB4P17483 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB4P17483 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms