Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3BA8MYP8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3BA8MYP8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF3BA8MYP8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms