Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC160A6NGH7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms