Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms