Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms