Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOPP49908 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms