Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCSO14618 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCSO14618 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCSO14618 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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