Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL4A3BPQ9Y5P4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL4A3BPQ9Y5P4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL4A3BPQ9Y5P4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL4A3BPQ9Y5P4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms