Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRPC5Q9UL62 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRPC5Q9UL62 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRPC5Q9UL62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPC5Q9UL62 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRPC5Q9UL62 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRPC5Q9UL62 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms