Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM8Q9UJA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM8Q9UJA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms