Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCA3Q99758 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCA3Q99758 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCA3Q99758 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCA3Q99758 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms