Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 MRS3YJL133W 945 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 YHR020WYHR020W 2067 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 HOG1YLR113W 1308 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 EHD3YDR036C 1503 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 ECM10YEL030W 1935 nt7.72□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 YHR131CYHR131C 2553 nt7.71□□□□□ -1.17
HRQ1Q05549 HED1YDR014W-A 489 nt7.71□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 GCN3YKR026C 918 nt7.71□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YMR034CYMR034C 1305 nt7.71□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 CTF8YHR191C 402 nt7.7□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YOR268CYOR268C 399 nt7.7□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 HEM1YDR232W 1647 nt7.7□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 EDC3YEL015W 1656 nt7.7□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 DOT1YDR440W 1749 nt7.69□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 CCR4YAL021C 2514 nt7.69□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YHR145CYHR145C 357 nt7.69□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 OCA1YNL099C 717 nt7.69□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YDR415CYDR415C 1125 nt7.68□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YLL056CYLL056C 897 nt7.68□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 RSP5YER125W 2430 nt7.68□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 RRP1YDR087C 837 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 HIS1YER055C 894 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YPT1YFL038C 621 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YJL144WYJL144W 315 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 SUR7YML052W 909 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 CWC25YNL245C 540 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 ZIM17YNL310C 525 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 PPM2YOL141W 2088 nt7.67□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 snR78snR78 87 nt7.66□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 AIM46YHR199C 933 nt7.66□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 RPR1RPR1 369 nt7.66□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 ERG10YPL028W 1197 nt7.66□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 ARP3YJR065C 1350 nt7.66□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 NUP49YGL172W 1419 nt7.66□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 SML1YML058W 315 nt7.65□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 CUE4YML101C 354 nt7.65□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 AIM41YOR215C 558 nt7.65□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 PET20YPL159C 762 nt7.65□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 COA2YPL189C-A 207 nt7.65□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YPR150WYPR150W 522 nt7.65□□□□□ -1.18
HRQ1Q05549 YPR204WYPR204W 3099 nt7.65□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YJL163CYJL163C 1668 nt7.64□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 GCD11YER025W 1584 nt7.64□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 COQ1YBR003W 1422 nt7.64□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 MFG1YDL233W 1377 nt7.64□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YNL092WYNL092W 1203 nt7.64□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 PRE2YPR103W 864 nt7.64□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 ARG81YML099C 2643 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 FBA1YKL060C 1080 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YOX1YML027W 1158 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 PRE5YMR314W 705 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 MOD5YOR274W 1287 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 FIT2YOR382W 462 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YKR023WYKR023W 1593 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 EDE1YBL047C 4146 nt7.63□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YHP1YDR451C 1062 nt7.62□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 ATG36YJL185C 882 nt7.62□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YKR032WYKR032W 315 nt7.62□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 MRPL19YNL185C 477 nt7.62□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YOL046CYOL046C 675 nt7.62□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 SKY1YMR216C 2229 nt7.62□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 MMS21YEL019C 804 nt7.61□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 YEL074WYEL074W 339 nt7.61□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 AGX1YFL030W 1158 nt7.61□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 DID2YKR035W-A 615 nt7.61□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 TMA46YOR091W 1038 nt7.61□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 DFR1YOR236W 636 nt7.61□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 CCC2YDR270W 3015 nt7.6□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 COX5AYNL052W 462 nt7.6□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 GAT1YFL021W 1533 nt7.6□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 PMT3YOR321W 2262 nt7.6□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 LAT1YNL071W 1449 nt7.6□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 SES1YDR023W 1389 nt7.59□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 ADE2YOR128C 1716 nt7.59□□□□□ -1.19
HRQ1Q05549 CIR2YOR356W 1896 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 MIA40YKL195W 1212 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 YNL120CYNL120C 486 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 URE2YNL229C 1065 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 YPR076WYPR076W 375 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 YBR113WYBR113W 483 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 THI2YBR240C 1353 nt7.58□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 MSY1YPL097W 1479 nt7.57□□□□□ -1.2
HRQ1Q05549 SNU66YOR308C 1764 nt7.57□□□□□ -1.2
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